2021年2月26日金曜日

PH値の違いがタイガーナッツの構造と成分を変える

 Effect of pH-shifting treatment on the structure and emulsifying properties of cyperus esculentus L. protein.


DOI : 10.7506/spkx1002-6630-20191014-113

Wang Lin, Zhou GuoWei, Yu ZhiChao, Meng LuoBing , Wang YuYing, Zhang AnQi, Wang Xibo, Jiang LianZhou

Shipin Kexue / Food Science Vol.41(22): 34-41 ref.43 (2020).

2021年2月23日火曜日

Cryptangieae連の再検討

 An updated generic circumscription for Cryptangieae (Cyperaceae, Poales) based on a molecular phylogeny and a morphological character reconstruction


https://doi.org/10.11646/phytotaxa.483.3.2

SUZANA M. COSTA, FABIO A. VITTA, WILLIAM W. THOMAS, A. MUTHAMA MUASYA, ROSEMERI MOROKAWA, VOLKER BITTRICH, GEORGE J. SHEPHERD, MARIA DO CARMO E. DO AMARAL

分類学的に問題のあるCryptangieae連について、DNA解析した結果、新たな属(Krenakia属)の新設を提唱し、属、種レベルでも再検討が必要であることが分かった。

2021年2月19日金曜日

セルビア ボイボディア州 南バチュカのカヤツリグサ科植物

 Floristic diversity of the central part of the South Bačka loess terrace (Vojvodina, Serbia)


DOI 10.5281/zenodo.4533996

Dragan OBRADOV, Boris RADAK, Bojana BOKIĆ, Goran ANAČKOV

Biologia Serbica 42(2): 5-25(2020).

Bolboschoenus maritimus コウキヤガラシノニム
Carex distans
Carex divisa
Carex hirta
Carex melanostachya
Carex praecox ヒメアサマスゲシノニム
Carex riparia
Carex spicata
Carex vulpina
Cyperus fuscus クロガヤツリ
Schoenoplectus lacustris オオフトイ

セルビア ボイボディア 南バチュカ -Google map-
https://goo.gl/maps/xuvTJoPeZWQUfCpn9

2021年2月16日火曜日

観光バスが植物の種子散布に一役買っていた(ヒマラヤ)

 Tourist vehicle as a selective mechanism for plant dispersal: Evidence from a national park in the eastern Himalaya


https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2021.112109

Mingyu Yang, Catherine M. Pickering, Lei Xu, Xin Lin

Journal of Environmental Management 285 (2021).

こまめな車体洗浄が必要

ヒマラヤ山脈 -Google map-

2021年2月12日金曜日

ハリイ属を銅吸着材として利用する試み(ペルー)

 Metallothionein production is a common tolerance mechanism in four species growing in polluted Cu mining areas in Peru


https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2021.112009

Juan Pablo PortillaLleren, Raúl Lima Coasaca, Herbert Omar Lazo Rodriguez, Sofía Ángela PortillaLlerena, Ysabel Diaz Valencia,Paul oMazzafera

Ecotoxicology and Environmental Safety 212 (2021).

材料となったハリイ属(Eleocharis montevidensis)は、比較検討した種類よりも銅吸収率は低かった。

2021年2月9日火曜日

希少種の調査をする前にアタリを付けるための一考

 Ensemble Species Distribution Model Identifies Survey Opportunities for At-Risk Bearded Beaksedge (Rhynchospora crinipes) in the Southeastern United States


https://doi.org/10.3375/043.041.0108

Carlos Ramirez-Reyes, Garrett Street, Francisco J. Vilella, D. Todd Jones-Farrand, M. Scott Wiggers, Kristine O. Evans

Natural Areas J. 41(1):55-63 (2021).

生育地を見つけるのが難しい種は、既存データを用いてGAM, MaxEnt, GBMなどのモデルで事前にシュミレーションをして調査すると効果的だった。

GAM (一般化加法モデル:Generalized Additive Model) 
MaxEnt(MaxEntモデル:Maximum Entropy Method)
GBM(一般化ブースト回帰モデル:Generalized Boosted Models)

Maxentを利用したクマタカ営巣適地の抽出(株式会社エコリス)2010年6月16日
https://www.ecoris.co.jp/technical/tec_tyousa/maxent.html

2021年2月5日金曜日

低コストで全植物に使えるAngiosperms353で系統解析してみた(広義Fuireneae連)

 Targeted sequencing supports morphology and embryo features in resolving the classification of Cyperaceae tribe Fuireneae s.l.


https://doi.org/10.1111/jse.12721

Julian R. Starr, Pedro Jiménez‐Mejías,  Alexandre R. Zuntini, Étienne Léveillé‐Bourret , Ilias Semmouri, Muthama Muasya, William J. Baker, Grace E. Brewer, Niroshini Epitawalage, Isabel Fairlie, Félix Forest, Izai A.B. Sabino Kikuchi, Lisa Pokorny, Isabel Larridon

分子系統解析では多系統となり立ち位置がぼやけていた広義Fuireneae連を「Angiosperms353」プローブを使って低コスト解析したところ、胚と細胞レベルの形態データとの関連があった。新連提唱あり。

「Angiosperms353」プローブの開発元
A Universal Probe Set for Targeted Sequencing of 353 Nuclear Genes from Any Flowering Plant Designed Using k-Medoids Clustering
Systematic Biology 68(4): 594–606(2019). https://doi.org/10.1093/sysbio/syy086

論文ポスター
https://arborbiosci.com/wp-content/uploads/2019/01/PAGXXVII-Poster-Angiosperms-353-Universal-Probe-Set.pdf

販売キット紹介
https://arborbiosci.com/genomics/targeted-sequencing/mybaits/mybaits-expert/mybaits-expert-angiosperms-353/

1サンプル20ドル!大変革かつ価格破壊の衝撃ツイート
Reducing #Angiosperms353 costs almost to 20 $/Sample is a game changer, especially for population studies… Levent Can(@Cn_lvnt)
https://twitter.com/Cn_lvnt/status/1288893891601747975

2021年2月2日火曜日

メキシコ高山地域のカヤツリグサ科植物

 Diversity and Origin of the Central Mexican Alpine Flora


https://doi.org/10.3390/d13010031

Victor W. Steinmann, Libertad Arredondo-Amezcua , Rodrigo Alejandro Hernández-Cárdenas and
Yocupitzia Ramírez-Amezcua

Diversity 13, 31 (2021). 

Carex curviculmis
Carex echinata キタノカワズスゲ
Carex geophila
Carex hermannii
Carex orizabae
Carex peucophila
Eleocharis acicularis チシママツバイ

イスタクシウアトル - ポポカテペトル国立公園-Google map-
https://goo.gl/maps/QbeUJtmBo9TQaiZUA