2018年11月5日月曜日

Oreobolus属の集団解析

SSR‐seq: Genotyping of microsatellites using next‐generation sequencing reveals higher level of polymorphism as compared to traditional fragment size scoring

Petra Šarhanová, Simon Pfanzelt, Ronny Brandt, Axel Himmelbach, Frank R. Blattner

Wiley Ecology and Evolution (2018).

これまで使われてきたSSR(単純反復配列)に加え、NGS(次世代シーケンシング)を使った新しい分析方法を提案。その際に解析した材料3種のひとつとしてカヤツリグサ科 obtusangulusがある。解析個体数は3種859個体。