Phylogeny and Classification of Carex section Ovales (Cyperaceae)
Andrew L. Hipp, Anton A. Reznicek, Paul E. Rothrock, and Jaime A. Webers Int. J. Plant Sci. 167(5): 1029-1048 (2006).
スゲ属Ovales節の系統と分類
要旨
１．section Ovalesの説明
２．分子系統解析の結果
３．分子系統解析結果とOvales節の形態分類の比較
はじめに Introduction
１．カヤツリグサ科について
２．スゲ連スゲ属について
１）生育環境
２）これまでの分子系統解析
３．section Ovalesについて
１）構成種
２）分布域
３）形態
４）分子系統解析の結果概要
５）分類学的取り扱いについて
４．本研究の目的
材料と方法 Material and Method
１．節内各グループごとの種数
２．従った分類体系とシノニム扱いとした種についての注意
３．DNA抽出とPCR
１）DNA抽出法
２）PCRプライマー
３）実験条件の変更点
４）cycle sequenceと解析機器
４．系統解析法１ Phylogenetic Analysis
１）使用ソフト
２）Indelの取扱い
３）ML法、ベイズ法、Ti/Tvの求め方
４）MP法のPaupでの設定
５）ブーツストラップ値を求める設定
６）MCMC法の使用ソフト、Modeltestの設定
５．系統解析法２ Tests of Data Partition Congruence and Topological Tests of Phylogenetic Hypotheses
１）PaupでのILDテスト設定
２）PaupでのSHテスト設定
６．外部形態と生物地理学的データ解析法 Analyasis of Morphological and Biogeographic Data
１）形態形質の取扱い：形質の評価に数値を与えた
７．細胞学的解析 Cytology
結果 Rersults
１．ITS+5.8S Data Matrix：解析方法、モデルテスト、結果
２．ETS Data Matrix：同上
３．単一DNA領域と組み合わせたデータの結果の比較Congruence and Analysis of Combined Data
４．ITS Phylogenetic Results: All Taxa：３の詳細
５．ETS Phylogenetic Results：３の詳細
６．Combined Analysis：３の詳細
７．分子系統解析結果に外部形態形質を乗せてみた結果 Character Evolution and Monophyly of Mackenzie's Species Groups
８．染色体で注目すべき種 Cytology of Carex roaimensis
→減数分裂観察でn=62(2n=124)！スゲ属で最大数。ミノボロ類より１０本多い。
考察 Discussion
１．分子系統解析結果（系統樹）と他の形質をあてはめて何が言えるか？
１）節内の特定のグループに注目して Data Congruence and the Origin of the Carex bonplandii Complex：グループの説明、グループの染色体の特徴
２）主役Ovales節の分化と姉妹群 Diversification and the Sister Group to Section Ovales
３）生物地理学的研究 Biogeography
４）外部形態の変異 Character Evolution and the Status of Mackenzie's Species Group
５）北アメリカ東部に分布するクレードについて The Eastern North American Clade I and ENA Clade II：クレードの種の外部形態、問題提起
６）北アメリカ西部に分布する種について The Western North American Grade：雑種もある、分布域、本研究で再同定された標本、サンプル採取時に注意
謝辞 Acknowledgements
参考文献 Literature Cited