A Comprehensive Database of Expert-Curated Occurrences for the Genus Carex L. (Cyperaceae)
https://doi.org/10.1111/geb.70123
María Sanz-Arnal1,2 | Pablo García-Moro1 | Carmen Benítez-Benítez3 | Marina Coca-de-la-Iglesia4 |
Angélica Gallego-Narbón4,5 | Consolación Barciela1 | Fabrizio Bartolucci6 | Prabin Bhandari7,8,9 | Matthew Bradley10 |Asunción Cano11 | Antoine Derouaux12 | Sabina Donadío13 | Marcial Escudero3 | Mariela Fabbroni14 |Kerry A. Ford15 | Gabriele Galasso16 | Sebastian Gebauer17,18,19 | M. Socorro González-Elizondo20 |David Hamon21 | Matthias H. Hoffmann22 | Xiao-Feng Jin23 | Jacob Koopman24 | Bangze Li7,8,9 |Raúl Lois1,25 | Yi-Fei Lu21,26 | Modesto Luceño1 | José Ignacio Márquez-Corro1 | Santiago Martín-Bravo1 |Attila Mesterházy27 | Mónica Míguez1 | Ana Morales-Alonso1,2 | A. Muthama Muasya28 |Paulo Muñoz-Schüler1,29 | Robert F. C. Naczi30 | Nora Oleas31 | Luciana Pereira-Silva32 | Radomír Řepka33 |Anton A. Reznicek34 | Katie K. Sanbonmatsu7 | Enmily Sánchez31 | Daniel Spalink7 | Arne Strid35 |Pieter Vanormelingen36 | Filip Verloove37 | Karen L. Wilson38 | Okihito Yano39 | Shuren Zhang8,9 |Pedro Jiménez-Mejías1
Global Ecology and Biogeography (2025).
データの品質
種の分布、生態、そして保全や管理に関する科学的な結論そのものを直接的に変えてしまう
>>ゴミからはゴミしか生まれない
→専門家による地道なデータ検証・修正作業が必要
（キュレーション）データの大掃除
問題
１．学名の不一致
２．不正確な採集記録
３．サンプリングの空白域（特に東南アジア）
具体的な作業
１．データ収集（オンライン、標本データ）
２．データ選択（1950年以前の記録は自動削除）
３．データ検証（Rの利用～目視）
本研究で用いたアルゴリズム
１．GAM（一般化加法モデル）
２．GBM（一般化ブースト回帰モデル）
３．GLM（一般化線形モデル）
４． RF（ランダムフォレスト）
５．SDM（種分布モデル）
2025年10月3日金曜日
データの精度と使いやすさの向上
2025年9月30日火曜日
韓国 全羅南道コフン郡の湿地のカヤツリグサ科植物
The Changes in Vascular Plants and Management Plan for Outstanding
Forest Wetlands in Goheung-gun, Jeollanam-do
https://doi.org/10.17663/JWR.2024.26.3.254
Jun Hyuk Lee, Jeong Eun Lee, Jun Gi Byeon, Jong Bin An, Ho Jin Kim, Chung Weon Yun
Journal of Wetlands Research 26(3): 254-265 (2024).
Carex dickinsii オニスゲ
Cyperus haspan コアゼガヤツリ 広義
Eleocharis tetraquetra マシカクイ
Rhynchospora chinensis イヌノハナヒゲ synonym
Rhynchospora faberi イトイヌノハナヒゲ
Schoenoplectiella wallichii タイワンヤマイ
Scleria rugosa マネキシンジュガヤ
韓国 全羅南道コフン郡 -Google map-
https://maps.app.goo.gl/aPjDTpViKEPCm4jcA
2025年9月26日金曜日
オーストラリア発カヤツリグサ科植物に寄生するダニ（２新属、６新種）
Two new genera and six new species of flat mites (Prostigmata: Tenuipalpidae) from Goodeniaceae (Asterales) in Australia
DOI: 10.11646/zootaxa.5637.2.1
JENNIFER J. BEARD, OWEN D. SEEMAN
Zootaxa 5637(2): 21 (2025).
<新属>
Goodeniacarus gen. nov.
Inglacarus gen. nov.
<新種>
Goodeniacarus leiperi sp. nov.
Goodeniacarus reticulatus sp. nov.
Goodeniacarus rosulatus sp. nov.
Goodeniacarus uri sp. nov.
Goodeniacarus wondul sp. nov.
Inglacarus jonesi sp. nov.
2025年9月23日火曜日
カラフトイワスゲにつくサビ病菌の詳細
The heteroecious life cycle of a rust fungus, Puccinia rupestris on Carex rupestris and its synonym of spermogonial and aecial stages, Aecidium saussurea-affinis
https://doi.org/10.1007/s10658-025-03117-x
Jing-Xin Ji, Yun-Feng Zhang, Zhuang Li, Chun-Jie Shi & Makoto Kakishima
European Journal of Plant Pathology (2025).
Carex rupestris カラフトイワスゲ
the uredinial and telial stages were observed of rust fungus
Puccinia rupestris
分布: 中国、日本、極東
河北省、中国 Hebei Province, China -Google map-
https://maps.app.goo.gl/EogxSbw2Uk4Hjqpm7
2025年9月19日金曜日
日本発ハバチ科のスゲ寄生の新発見
Discovery of Host Plants and Larvae of Three Species of Tenthredinidae
(Hymenoptera, Symphyta) in Japan
DOI: 10.50826/bnmnszool.51.2_57
Yu Kato
Bull. Natl. Mus. Nat. Sci., Ser. A, 51(2): 57–62 (2025).
種名：Eutomostethus togashii Seiyama, 1981
寄生植物：Carex sp. (新記録).
発見地：埼玉県 越谷市 元荒川
2025年9月16日火曜日
染色体レベルのゲノム再配列による雑種形成起源の手がかり
https://doi.org/10.1038/s41597-025-05204-4
Yu Ning, Yang Li, Chun Yi Li, Jin Zhi Wang, Tian Shi Wang, Yan Chao Zheng, Yang Ying Zhan, Shen Jian Xu, Shu Bin Dong & Yi Fei Wang
Sci Data 12: 839 (2025).
genome assembly:
227.75Mb (contig N50: 3.89Mb)
NCBI (no. GCA_037678475.1)
Annotation file (https://doi.org/10.6084/m9.figshare.25479922.v1)
Bioproject ID (PRJNA1079027)
Biosample ID (SAMN40029249)
Sequence Read Archive (SRP491792)
haploid karyotype comprising:
54 pseudochromosomes (ave. 4.05Mb)
telomere to telomere level:
32 pseudochromosomes (54.12%)
predicted and annotated:
25,239 protein-coding genes
BUSCO score:
95.10%
duplicated genes:
1.70%
the origin of S. mariqueter:
need to more study for hybrid speciation
ゲノムアセンブリの手法（OIST)
https://www.oist.jp/ja/image/representation-genome-assembly-method
新規ゲノムアセンブリとアノテーション（日本生物工学学会）
https://www.sbj.or.jp/wp-content/uploads/file/sbj/9509/9509_bioinformatics.pdf
2025年9月13日土曜日
2014年以降に北海道で新たに記録された 維管束植物分類群の集約
doi: 10.18942/chiribunrui.0731-02
首藤光太郎
植物地理・分類研究 73(1): 9-33 (2025)
アメリカミコシガヤ 2017
コツブアメリカヤガミスゲ 2015
マツバスゲ 2015
スナジスゲ 2015
タカネナルコ 2015
ヤワラスゲ 2024
タチヒメクグ 2015
チャボイ 2017
ミヤマホタルイ 2014
ミチノクホタルイ 1997
ノグサ 2021
イワキアブラガヤ 2016
セフリアブラガヤ 2016