染色体レベルのゲノム再配列による雑種形成起源の手がかり

Chromosome-level genome assembly for clubrush (Scirpus × mariqueter) endemic to China

https://doi.org/10.1038/s41597-025-05204-4

Yu Ning, Yang Li, Chun Yi Li, Jin Zhi Wang, Tian Shi Wang, Yan Chao Zheng, Yang Ying Zhan, Shen Jian Xu, Shu Bin Dong & Yi Fei Wang

Sci Data 12: 839 (2025).

genome assembly:
227.75Mb (contig N50: 3.89Mb)
 NCBI (no. GCA_037678475.1)
 Annotation file (https://doi.org/10.6084/m9.figshare.25479922.v1)
 Bioproject ID (PRJNA1079027)
 Biosample ID (SAMN40029249)
 Sequence Read Archive (SRP491792)

haploid karyotype comprising:
54 pseudochromosomes (ave. 4.05Mb)

telomere to telomere level:
32 pseudochromosomes (54.12%)

predicted and annotated: 
25,239 protein-coding genes

BUSCO score:
95.10%

duplicated genes:
1.70%

the origin of S. mariqueter:
need to more study for hybrid speciation 

ゲノムアセンブリの手法（OIST)
https://www.oist.jp/ja/image/representation-genome-assembly-method

新規ゲノムアセンブリとアノテーション（日本生物工学学会）
https://www.sbj.or.jp/wp-content/uploads/file/sbj/9509/9509_bioinformatics.pdf

2014年以降に北海道で新たに記録された 維管束植物分類群の集約

doi: 10.18942/chiribunrui.0731-02

首藤光太郎

植物地理・分類研究　73(1): 9-33 (2025)

アメリカミコシガヤ 2017
コツブアメリカヤガミスゲ 2015
マツバスゲ 2015
スナジスゲ 2015
タカネナルコ 2015
ヤワラスゲ 2024
タチヒメクグ 2015
チャボイ 2017
ミヤマホタルイ 2014
ミチノクホタルイ 1997
ノグサ 2021 
イワキアブラガヤ 2016 
セフリアブラガヤ 2016

北海道東部茨散沼湿原および兼金沼湿原の 植物相・植生・形成史の研究

根室半島自然史研究グループ:
冨士田裕子・近藤玲介・加藤ゆき恵・金子和広・ 石川弘晃・首藤光太郎・井上　京

自然保護助成基金助成成果報告書 34: 36-50 (2025).

ハクサンスゲ
ハリガネスゲ
カブスゲ
クシロヤガミスゲ
キタノカワズスゲ
カンチスゲ 
カワラスゲ
ヒカゲスゲ
ムジナスゲ
イトナルコスゲ
ヤチスゲ
ムセンスゲ
チャシバスゲ
トマリスゲ
ヤチカワズスゲ"
"ツルスゲ
カミカワスゲ
ホロムイクグ
エゾハリスゲ
オニナルコスゲ
ヌマハリイ
シロミノハリイ
シカクイ
サギスゲ
ワタスゲ
ミカヅキグサ
コイヌノハナヒゲ
ホタルイ
ヒメワタスゲ"

黒穂病など菌類が発見されたカヤツリグサ科植物 （米国インディアナ州より）

Checklist of Rust Fungi (Basidiomycota, Pucciniales) and their hosts in Indiana, United States of America

DOI: 10.3897/mycokeys.121.148853

Terry J. Torres-Cruz, Mehrdad Abbasi, D. Rabern Simmons , M. Catherine Aime

MycoKeys 121: 167–235 (2025).

Puccinia angustata Peck
 Eriophorum virginicum
 E. viridicarinatum
 Scirpus atrovirens　イワキアブラガヤ　synonym
 S. cyperinus　 シデアブラガヤ　synonym

Puccinia canaliculata (Schwein.) Lagerh.
 Cyperus esculentus　ショクヨウガヤツリ
 C. filiculmis　アレチハマスゲ
 C. odoratus　キンガヤツリ
 C. strigosus コガネガヤツリ
 C. schweinitzii

Puccinia caricina DC., s.lat.
 Carex blanda
 C. bullata
 C. cephalophora
 C. conoidea
 C. crinita 
 C. davisii
 C. digitalis 
 C. emoryi
 C. frankii
 C. gracilescens 
 C. hirtifolia 
 C. hitchcockiana
 C. laxiflora 
 C. lupuliformis 
 C. lurida 
 C. rosea 
 C. siccata 
 C. sparganioides 
 C. squarrosa
 C. stricta
 C. tetanica
 C. trichocarpa

Puccinia cyperi Arthur
 Cyperus echinatus
 C. lupulinus subsp. lupulinus
 C. schweinitzii
 C. strigosus

Puccinia dioicae Magnus, s.lat.
 Carex albicans var. albicans
 C. annectens
 C. brevior
 C. cephaloidea 
 C. cephalophora
 Carex cf. frankii
 C. communis
 C. conoidea
 C. festucacea
 C. jamesii 
 C. laeviculmis 
 C. laeviconica 
 C. lanuginosa 
 C. lupuliformis
 C. muskingumensis
 C. nebrascensis 
 C. normalis 
 C. oligocarpa 
 C. pellita 
 C. pensylvanica 
 C. rosea 
 C. siccata
 C. sparganioides 
 C. stenolepis
 C. stipata オオカワズスゲ
 C. straminea 
 C. tetanica 
 C. tribuloides 
 C. trichocarpa 
 C. umbellata 
 C. virescens 
 C. vulpinoidea ナガバアメリカミコシガヤ
 C. willdenowii 
 Dulichium arundinaceum
 D. spathaceum

Puccinia eleocharidis Arthur
 Eleocharis obtusa
 Eleocharis palustris　クロヌマハリイ　広義

Puccinia eriophori Thüm.
 Eriophorum angustifolium　シュムシュワタスゲ
 E. virginicum

Puccinia minutissima Arthur
 Carex lasiocarpa　コムジナスゲ

Puccinia obtecta Peck
 Schoenoplectus lacustris　オオフトイ
 S. pungens
 S. tabernaemontani　フトイ
 S. americanus 

Puccinia sambuci (Schwein.) Arthur
 Carex aureolensis
 C. lupuliformis 
 C. lupulina 
 C. lurida 
 C. trichocarpa 

Puccinia urticata F. Kern
 Carex bullata 
 C. emoryi 
 C. frankii 
 C. lacustris 
 C. lurida 
 C. pensylvanica 
 C. siccata 
 C. stipata オオカワズスゲ
 C. straminea 
 C. stricta 
 C. trichocarpa 
 C. virescens 
 Dulichium arundinaceum

Uromyces americanus Speg.
 Schoenoplectus tabernaemontani フトイ

Uromyces lineolatus subsp. nearcticus Savile
 Schoenoplectus americanus
 S. fluviatilis
 S. tabernaemontani フトイ

Uromyces minutus Dietel
 Carex lanuginosa 
 C. virescens

Uromyces perigynius Halst.
 Carex albicans var. albicans
 C. grayi 
 C. intumescens
 C. pubescens 
 C. tribuloides 

Uromyces rhynchosporae Ellis
 Rhynchospora alba　ミカヅキグサ　
 R. capitellata アメリカイヌノハナヒゲ
 R. glomerata 

Uromyces valens F. Kern
 Carex lupulina 
 C. rostrata カラフトカサスゲ　
 C. utriculata

フィリピン ノーザンサマル地方の帰化植物としてのカヤツリグサ科植物

INVASIVE ALIEN PLANT SPECIES IN THE RIPARIAN AREAS OF NORTHERN SAMAR, PHILIPPINES

DOI: 10.11598/btb.2025.32.2.2368

Joey Liza L. Abobo*, Joy A. Esmabe, Marjurie L. Baldoza, Princess L. Cerbito, John Mark P. Garbo, Ramon Philip L. Bacayo, Chitlyn C. Tenedero, Maricar D. Lameda, Rica Joy B. Saavedra, Cresil S. Turbanada, and Roanne B. Romeroso

Biotropia 32(2): 151-161 (2025).

Actinoscirpus grossus　オオサンカクイ
Cyperus brevifolius　アイダクグ
Cyperus iria　コゴメガヤツリ
Cyperus rotundus　ハマスゲ
Scleria scrobiculata　マシンジュガヤ

フィリピン　ノーザンサマル地方 -Google map-
https://maps.app.goo.gl/RwEyb4ddJhtcvzEB7

染色体進化のレビューと今後の展望

Bridging micro and macroevolution: insights from chromosomal dynamics in plants

https://doi.org/10.3389/fpls.2025.1606450

Carmen Benítez-Benítez, Ashwini V. Mohan, Rogelio Sanchez-Villegas, Ines Gomez-Ramos, Ana Valdes-Florido, Kay Lucek, Marek Slovak, Filip Kolar, Ilia J. Leitch, Modesto Luceno, Isabel Larridon, Angelino Carta, Joan Cusco-Borras, Enrique Maguilla, Alegría Montero-Ramírez, Patrick G. Meirmans, Alison Dawn Scott, Santiago Martín-Bravo, Marcial Escudero

Plant Systematics and Evolution 16 (2025).

特に、マクロ進化の時間スケールにおける異数性、構造的変異、および染色体再編成（染色体動態）による進化スケールをまたぐ選択が次の段階に重要

雑種では無い！Ficinia lucida（アフリカ）

Hybridization in the Cape flora: the case of Ficinia lucida (Cyperaceae)

https://doi.org/10.1016/j.sajb.2025.07.046

Benjamin D. Williams, Timothy M. Muthama, 
Daniel A. Zhigila, Alfred A. Oteng-Yeboah,
, A. Muthama Muasya

South African Journal of Botany 185: 412-421 (2025).

Ficinia lucidaは、Ficinia cedarbergensisとFicinia ixioides subsp. glabraの種間雑種と考えられていたが標本調査の結果、雑種では無かった。